Page 80 - 畜牧兽医与现代农业技术研究
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Research on Animal Husbandry and Veterinary Medicine and Modern Agricultural Technology
畜牧兽医与现代农业技术研究
Ct 值(qPCR 技术)不能达到较好分辨效果的不足。在动物疫病检测中,可以用
与 qPCR 相同的反应混合物和循环条件设计 dPCR 方案,使结果更准确,从而可
以进行更精确的诊断。
1.dPCR 在细菌性动物疫病检测的应用
梅力等建立的布鲁菌微滴数字 PCR 检测方法,最低检测下限可达 1.12 拷
贝 /μL,可对布鲁菌感染的临床样品进行定量检测。田国忠等建立了布鲁菌微滴
数字 PCR 方法,布鲁菌核酸 DNA 为 3.68fg/ 反应时,ddPCR 检出靶标基因拷贝
数可达 1 拷贝 / 反应,可检测微量核酸 DNA。Song 等利用 ddPCR 检测结核分枝
杆菌特异性基因(M.tb-specific CFP10),对于 ddPCR,CFP10 的检测限为 1.2
拷贝 /μL,而 qPCR 为 15.8 拷贝 /μL。王建峰等针对幼虫芽孢杆菌 16SrRNA 基因
建立幼虫芽孢杆菌微滴式数字 PCR 检测方法,检测灵敏度可达 2.9 拷贝 /μL。
2.dPCR 在病毒性动物疫病检测的应用
Zhao 等利用 ddPCR 检测法分别对副痘病毒属(PAPV)目前已知所有病毒,
如羊口疮病毒(ORFV)、伪牛痘病毒(PCPV)和牛丘疹性口炎病毒(BPSV)等
进行了检测。Benjamin 等首次应用 ddPCR 技术在高通量样品条件下对二代测序技
术进行验证。Boettger 等首次证明了 ddPCR 试验结论与 NGS 结论高度吻合。邬旭
龙等建立的非洲猪瘟病毒 ddPCR 方法,ddPCR 的最低检测限度可达到 0.36 拷贝,
灵敏度是 qPCR 的 10 倍。兰德松等研究建立的 ddPCR 方法对 PRVgD、gE 基因的
敏感性比相应的 qPCR 方法高 10 倍。董桂伟建立了禽腺病毒检测方法,qPCR 检
出质粒标准品的最低浓度为 100 拷贝 /μL,而 ddPCR 方法为 10 拷贝 /μL。
3.dPCR 在寄生虫病检测的应用
目前对于低丰度目标序列的检测,定量 PCR、杂交等方法都因受到背景
DNA 的干扰,使得检测灵敏度及精确性都达不到精确定量的要求。与相同生物
材料上进行的 qPCR 相比,dPCR 显示出高灵敏度的检测,尤其是在含有 PCR 扩
增抑制剂的样品中,如对粪便中隐孢子虫的定量分析。dPCR 在要求高精度进行
定量检测的诊断中是一种较有效的方法,例如临床样品中的寄生虫负荷,以及患
者之间或在不同时间点采集的样品中寄生虫的统计比较。在血吸虫病检测中,某
种程度上 dPCR 结果能够更早和特异性检测到日本血吸虫。据报道,dPCR 检测
法是检测和定量核酸小片段(例如 cfDNA 和 micro-RNA)的新方法,是一个有
希望的潜在诊断应用,尤其是在针对血吸虫病消除的国家和地区。Yu 等建立羊
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