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第八章 时空信息世界学 305
要知道密码子的起源。除了少数的不同之外,地球上已知生物的遗传密码均非常接
近;因此根据演化论,遗传密码应在生命历史中很早期就出现。现有的证据表明遗
传密码的设定并非随机的结果,对密码子起源的研究曾有以下许多的理论。
韦斯(Carl Richard Woese)认为,一些氨基酸与它们相对应的密码子有选择
性的化学结合力(立体化学假说,Stereochemical Hypothesis),这显示现在复杂
的蛋白质制造过程可能并非一早存在,最初的蛋白质可能是直接在核酸上形成。
但王子晖(J. Tze-Fei Wong)认为,氨基酸和相应编码的忠实性反映了氨基酸生
物合成路径的相似性,并非物理化学性质的相似性(共进化假说,Co-evolution
Hypothesis)。谢平提出,遗传密码子是生化系统的一部分,因此,必须与生化系
统的演化相关联,而生化系统的核心是 ATP,只有它才能建立起核酸和蛋白质之间
的联系(ATP 中心假说,Atp-centric Hypothesis)。
还有所谓的综合进化假说、试管选择(In Vitro Selection)假说、解码(Decoding)
机理起源假说、第二遗传密码(Second Genetic Code)假说等等。
人们推测,三联体密码从两种类型的双联体密码逐渐进化而来,这两种双联
体密码是按照三联体密码中固定的碱基位置来划分的,包括前缀密码子(Prefix
Codons)和后缀密码子(Suffix Codons)。不过,Baranov 等推测三联体密码子是
从更长的密码子(如四联体密码子 Quadruplet Codons)演变而来,因为长的密码子
具有更多的编码冗余从而能抵御更大的突变压力。
这么多的争论也没说清楚最原始的密码子是怎么来的,实际上也就是生物进化
过程的化学进化阶段。有机大分子的自组织过程随机出现,特别是在有自我复制能
力的有机分子的自组织过程中产生。之后随着生命体的进化而经历上述的可能的途
径演化成为现代生物的基因结构。当然,随着蛋白质的三维空间结构的研究取得空
前进展,遗传密码子的生成和演化机理自然会更容易明了。
(二)生物基因的相似性
地球上(绝大多数)生物,都源于某一个真核细胞生物。所以事实就是所有动
植物,甚至绝大部分真菌,都在使用完全一样的氨基酸密码子,只有细菌等原核生
物可能会有不同。因此,甭管你是看到食物开始流口水了,还是吃下去胃要分泌消
化酶,或者某个大豆想合成一点大豆蛋白,或者青霉菌决定生产一点青霉素杀一杀
跟它竞争的其他菌种……差不多的生物功能都会源于相似的过程。

