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废水处理与环境影响评价研究
R912 菌株的转录组测序和分析显示，在 Cd 胁迫下，R912 菌株中有镉耐受
性相关的基因 JQN66-RS04205 表达的倍数变化为 20.82，其中 2 个β- 内酰胺
酶编码基因包括 JQN66-RS10000 和 JQN66-RS11525 表达上调，其变化倍数为
2.51 和 2.50，与其他类型的抗生素耐药性有关的基因也有表达上升，如 JQN66-
RS17940 与磺胺耐药性有关，其变化倍数为 5.06。
图 4-6 R912 菌株在镉和美罗培南胁迫下的上调基因
（四）美罗培南与 MBL 蛋白的分子对接
细菌对于 MEM 的降解是依靠 β 内酰胺酶。由于菌株 R51 可以有效地
降解 MEM，我们使用分子对接算法来确定 β- 内酰胺酶能否与 MEM 进行对
接，其中包括 JQN61-03315 编码的 MBL。采用基于 2DFK 的 Swiss 模型构建
了 JQN61-03315 的同源模型，即 MBL 的晶体结构，同源性为 38.92%，然后用
DisvordodStudio2.0 将美罗培南和 MBL 进行分子对接，如图 4-7 所示。JQN61-
03315 蛋白与 MEM 对接良好，对接评分为 121.867，说明 MBL-MEM 对接模
型具有较高的可信度。在该模型中，形成了一个疏水隧道，美罗培南能够穿过
疏水隧道，图 4-7，表明 JQN61-03315 可以水解 MEM。其他三种 β- 内酰胺酶
（QN61-10185、JQN61-11940 和 JQN61-04945）也用相同的方法使用 MEM 建模，
然而这三种酶都没有与 MEM 结合。
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