Page 94 - 化学分析与检测技术

化学分析与检测技术
Chemical Analysis and Detection Techniques

和均方根偏差（RMSD）的变化趋势，分析得出螺旋结构变形程度及初始构象与
平衡构象的平均原子位移。结果表明螺旋络合物展开效应与温度呈正相关，且络
合物的展开是一个吸热过程。MD 模拟已成为研究直链淀粉及 V 型螺旋结构的
有效方法之一。López 等研究直链淀粉短片段在脂质存在下的折叠和络合过程。

Schahl 等用 MD 方法对与棕榈酸相结合的小直链淀粉进行结构分析。Cheng 等研
究直链淀粉－脂肪酸复合物和作为参考的单一直链淀粉分子在水中的构象变化。
Cui 等对淀粉，尿素和水的混合物之间的关系进行了深入研究。
β －环糊精同样作为多糖类聚合物，多用于 pH 响应。Akhondi 等构建了其

在非质子化及质子化下的结构变形并列出变形细节，用 MD 方法模拟了 β －环
糊精与阿霉素（DOX）的复合物，评估了药物与载体间的氢键数目、非键相互
作用及药物与载体间的摆锤质心距。结果表明，质子化状态下，药物包裹在中性
载体中的体系具有几乎恒定的氢键数；非质子化条件下，药物与载体间没有氢键，

距离可忽略不计，且随着时间的推移，距离逐渐减小。这一结果证实了质子化载
体在非质子化条件下的不稳定性，从而使药物从质子化载体中释放出来。
碳纳米管（CNTs）也是近年来被用于 MD 模拟药物递送系统的重要载体之
一。Tohidifar 等采用 MD 方法模拟了紫杉醇（PTX）在单壁碳纳米管（SWCNTs）

及经—OH、—COOH 和 PW3 肽修饰的 SWCNTs 上的吸附。Lee 模拟了 CNTs 的
细胞膜穿透和聚集。Arsawang 等模拟研究了抗癌药物吉西他滨在 SWCNTs 中包
封所需的结构特性，发现药物分子更喜欢通过在 CNTs 和药物的胞嘧啶环间形成
π －堆积相互作用而驻留在 SWCNTs 中。

2. 蒙特卡洛法
蒙特卡洛（MonteCarlo,MC）模拟是研究分子体系时出现的第一个计算机模
拟方法，通过随机抽样的方式，计算获取构象能量或概率因子与产生随机数比较，
来决定拒绝或接受结果。

超支化聚合物可用于显示器荧光剂、荧光探针、纳米复合涂层等。在生物医
药领域应用可提高药物溶解度、稳定和保护对周围环境敏感的药物，延长血液循
环时间，实现药物的靶向递送，但由于其具有高灵活性、无法结晶，它们的三维
结构通常不能在实验中确定。因此，只有使用计算化学方法才能研究它们在原子

学水平上的构象和相互作用。Zloh 等使用迭代随机原子位移来生成树状大分子构
象，以寻找最小势能构型。然而，由于 MC 模拟过程中缺乏动态信息，MC 在树

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