Page 142 - 医学检验技术发展与创新
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医学检验技术发展与创新
Development and Innovation of Medical Laboratory Technology
关或在胃肠道中发现的所有病毒制备了微阵列芯片,并对 76 例胃肠炎儿童临床
样本进行检测,检测率达 92%,同时检测出了共感染。与 RT-PCR 分析相比,
微阵列的另一个优势是能够识别罕见病毒。Liu 等开发了一种应用基因芯片技
术,检测与中枢神经系统感染相关的人疱疹病毒和肠病毒。作者以人疱疹病毒的
DNA 聚合酶基因和肠病毒的 5'-UTR 为靶基因设计引物和探针,在临床样本检测
中,微阵列对所有病毒的检测特异性都在 96% 以上,灵敏度稍有偏差。此外,
基因芯片在检测抗生素抗性(ABR)基因中也有应用。Wolff 开发了一种基于微
阵列检测 ABR 的方法,研究者基于末端脱氧核苷酸转移酶(TDT)反应设计了
微阵列芯片,结果表明此方法与商业化检测相比,特异性与灵敏度没有显著差异,
但成本显著降低。
高通量测序因其准确性高、周期短、通量大,而作为发现病原体的有力工
具被广泛使用。可以应用高通量测序对耐药基因进行分析。丁月平等应用全基因
组测序技术(WGS)对碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)进行测序及耐药
基因筛选,共发现 48 种耐药基因,这为 CRKP 的治疗与防控提供了科学依据。
2020 年肆虐的新型冠状病毒病(COVID-19)将感染性疾病推到了大众视野
面前,在 COVID-19 的检测中,广泛应用了 HTS 技术。张永振与 Holmes 教授应
用 HTS 对一名新冠肺炎患者的支气管肺泡灌洗液样品进行检测,首次获得了新
型冠状病毒(SARS-CoV-2)完整基因组并上传到 GenBank(MN908947),这对
COVID-19 的防治和研究意义重大。Kim 等收集了韩国的 COVID-19 患者的鼻咽
样本,分离病毒后接种到 Vero 细胞中,提取病毒 RNA 合成 cDNA,构建 NGS 文
库,分析结果表明该病毒序列与先前报道的 SARS-CoV-2 序列包含在同一簇中,
并且与SARS-CoV-2序列有高度同源性(>99.5%)。宏基因组学下一代测序(mNGS)
方法能快速鉴定病原体,是信息时代病毒诊断的趋势,针对从不同患者来源获取
的样本进行测序,还可以追溯 SARS-CoV-2 的起源并对病毒变异进行研究。Chen
等通过 mNGS 技术对 COVID-19 进行了鉴定,研究者对 2 名患者进行常规呼吸道
病原体检测,结果均为阴性,应用 SARS-CoV 特异性 RT-PCR 分析,仅有一组
产生了阳性结果,应用 mNGS 技术进行测序后比对才确认该病毒并不是 SARS-
CoV,而是一种新型冠状病毒即 SARS-CoV-2,并且 2 名患者的检测样本中共有
基因组序列是相同的,说明他们感染的是同一种病毒。
此外,也有大量 RT-PCR 试剂盒被开发用于 COVID-19 检测。武汉大学中
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