Page 145 - 医学检验技术发展与创新

第四章 分子诊断临床应用

速度快。特别是半导体测序仪，每次运行所需时间仅数小时。第三，测序成本低。
应用 Ion Torrent 检测平台对数十个基因的测序成本与应用 Sanger 技术对单个基因
的测序成本大致相当。第四，敏感性高。特别是对于取样不均一的样本，NGS 能
稳定检测 >1% 的突变信息，对于检测异质性相对较高的肿瘤样本特别重要。第五，

所需样本量少。对 DNA 样本的要求仅为 ng 数量级。总之，NGS 技术能够一次性
对多个靶基因进行准确检测，具有所需样本量小、敏感性高、检测成本低、耗时
短等优点。
（二）NGS 技术在临床诊断中的应用

在NGS技术快速发展的同时也加速了该技术在临床分子诊断中的广泛应用。
根据检测目的不同，NGS 技术在临床中的应用主要分为以下 2 种策略：第一，针
对已知病因的疾病设计合适的芯片，直接对多个已知的致病基因进行靶向基因组
测序；第二，针对未知病因的疾病对外显子组或全基因组进行测序。

在临床应用中以上 2 种测序方式各有优缺点。靶向基因组测序的优点在于
具有较高的测序深度、较低的检测成本，同时减轻了临床医生对高通量数据分析
的压力，具有较好的应用前景，特别适合于复杂性疾病的临床分子诊断。缺点是
当临床患者实际需要检测的基因数 < 芯片中包含的基因数量时，会导致资源浪费

和检测成本升高。另外，当需要将新的基因添加到芯片中时，需要重新设计芯片
并再次通过临床质量验证。而外显子组或全基因组测序技术的优点在于能够发现
新的致病基因，但是测序成本相对较高。对于检测到的一些突变信息，有时还需
要对患者进行跟踪随访，根据随访信息再确定突变位点是否具有临床应用价值。

目前，靶向基因组测序在临床诊断中最广泛的应用是针对癌症亚型的临床
诊断与治疗。如针对遗传性癌症的风险评估，利亚德基因公司针对 25 个癌基因
中的突变位点开发了“MyRisk panel”芯片，专门针对乳腺癌、大肠癌、卵巢癌、
子宫内膜癌、胰腺癌、前列腺癌、胃癌及黑色素瘤等 8 种癌型并结合家系信息

进行遗传风险评估和健康管理。针对美国食品与药品监督管理局（U.S.Food and
Drug Administration，FDA）批准的临床药物，llumina 公司针对 26 个基因的突变
位点开发了“TruSight Tumor panel”芯片，根据实际检测结果针对肺癌、结肠癌、
胃癌、宫颈癌进行靶向治疗。另外还有“AmpliSeqCancerPanelV1”芯片、“Truseq

Amplicon cancer panel”芯片等。除此之外，NGS 还广泛应用于肾病、糖尿病、
心血管疾病等其他复杂疾病的临床诊断中。而外显子组和全基因组测序在临床

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